Kalcitas yra plačiai paplitęs gamtoje.
Sekliose jūrose ar ežeruose jis dažnai nusėda ir sudaro didelius kalkakmenio sluoksnius.
Požeminis vanduo gali ištirpinti kalkakmenį ir reformuoti kalcitą, pvz., stalaktitus, stalagmitus ir travertiną. Požeminis vanduo, aktyvus dirvožemyje šalia vandens lygio, dažnai sudaro kalcito mazgus, išsidėsčiusius tam tikroje horizontalioje plokštumoje; geologai dažniausiai tai vadina kalkingais mazgeliais.
Dėl hidroterminės veiklos dažnai susidaro kalcito gyslos, kai kuriose yra mineralų, o kitose – ne. Geoduose dažnai randami gerai-formuoti kristalai.
Karbonatuose, susidariusiuose dėl magminės veiklos, kalcitas paprastai sudaro apie 80%.
Be to, kalcitas taip pat veikia kaip cementas klastinėse nuosėdinėse uolienose ir kaip mineralas, gaunamas keičiant pagrindines magminės uolienas, prisidedant prie įvairių uolienų susidarymo. Dėl požeminio vandens aktyvumo kalcito gyslos dažnai užpildo įvairių uolienų plyšius.
Sedimentacijos būdu susidaręs kalkakmenis dažnai patiria regioninį arba kontaktinį metamorfizmą, kurio metu jame esantis kalcitas persikristalizuoja ir sudaro stambesnius kalcito agregatus{0}}marmurą.
